Bakteri heterotrof merupakan bakteri yang memperoleh energi dari bahan organik di sekitarnya.bakteri heterotrof terbagi menjadi dua kelompok yaitu bakteri paras

Bakteri saprofit yaitu bakteri yang hidup pada jasad yang telah mati, umpamanya, sampah, bangkai, atau kotoran.
Bakteri parasit yaitu bakteri yang hidupnya menumpang pada makhluk hidup lain.
contoh bakteri saprofit adlah Lactobacillus bulgaricus, contoh bakteri parasit Salmonela thyposa -> menyebabkan terserang penyakit tifus